Description du poste :

Le laboratoire de diagnostic moléculaire du CHUM est responsable de la majorité des analyses spécialisées et suprarégionales de la grappe Optilab Montréal-CHUM. À la fine pointe des avancées techniques et cliniques, le laboratoire participe au développement du réseau québécois de diagnostic moléculaire (RQDM). En pleine expansion, nous sommes à la recherche d’un(e) candidat(e) pour combler un poste de spécialiste en bioinformatique. Vous intégrerez une équipe de 20 technologistes, 3 spécialistes techniques et de 5 spécialistes cliniques en sciences biomédicales.

Sous la responsabilité médicale du directeur du laboratoire de biologie moléculaire et l’autorité de la chef de service, et en étroite collaboration avec les spécialistes cliniques en biologie médicale, le/la spécialiste en bioinformatique sera responsable, entre autre, du déploiement et de la maintenance de pipelines d’analyse de données de séquençage de nouvelle génération (NGS) pour les secteurs de génétiques, hématologie, pathologie et microbiologie.

Responsabilités détaillées :

· Développe et maintien des pipelines d’analyses bioinformatiques pour les données NGS cliniques avec la technologie Illumina;
· Gère l’archivage des données cliniques NGS dans la plateforme du serveur Illumina BaseSpace Cloud;
· Élabore, surveille et maintien les activités de contrôle de la qualité des analyses bioinformatiques;
· Crée et maintien les bases de données de variations. Est responsable de l’intégration de ces données dans un rapport clinique;
· Aide à l’évaluation, l’implantation et la maintenance des solutions commerciales (pipelines d’analyse);
· Supporte les utilisateurs avec les analyses bioinformatiques et la maintenance de bases de données;
· Participe à la formation des résidents en médecine, étudiants gradués, technologistes médicaux et autres professionnels;
· Crée et mets à jour toute la documentation en lien avec ces projets afin de respecter les normes nationales en vigueur.

Exigences :

· Doit détenir un baccalauréat dans une discipline appropriée au laboratoire ou bio-informatique (bio-informatique, statistiques, sciences informatiques ou domaine connexe)
· Diplôme universitaire de deuxième cycle dans une discipline pertinente à l’emploi (bio-informatique, informatique ou domaine connexe), serait atout;
· Forte expérience en développement et maintenance d’outils informatiques utilisés pour les analyses de données de séquençage de nouvelle génération (Expérience avec la plateforme Illumina requise);
· Expérience avec Python, Shell, R, environnement Linux, entre autres;
· Compétences démontrées en conception, implantation, gestion et utilisation de systèmes de base de données;
· Capacité à générer des synthèses et des rapports, produire des analyses complexes;
· Expérience avec des données provenant de maladies génétiques et le profilage de tumeurs est un atout;
· La maîtrise de la langue française orale et écrite est essentielle; une connaissance de l'anglais écrit et parlé est souhaitable.

Aptitudes personnelles :

• Bonne capacité d’intégration et de collaboration avec l’équipe interdisciplinaire;
• Faire preuve de leadership;
• Efficacité au travail: gestion des priorités et organisation;
• Adaptation aux changements et résolution de problèmes;
• Bonne aptitudes en communication et transfert de connaissances

Remarques :

Nous remercions toutes les personnes qui poseront leur candidature, mais ne communiquerons qu'avec celles retenues pour un test ou une entrevue.

Le genre masculin est utilisé sans discrimination et dans le seul but d'alléger le texte.

Le CHUM applique un programme d'accès à l'égalité et invite les femmes, les autochtones et les membres de minorités visibles et ethniques à présenter leur candidature.

Diplôme obtenu hors Québec : Nous exigeons l'évaluation comparative des études émise par le ministère de l’Immigration et des
Communautés culturelles: www.immigration-quebec.gouv.qc.ca/fr/emploi/evaluation-comparative/index.html.

Il est "essentiel" de joindre votre CV au présent formulaire pour que votre candidature soit considérée.